Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5F9

Setd2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, mousemouse

Predictions only

Length 2,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd2E9Q5F9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd2E9Q5F9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd2E9Q5F9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd2E9Q5F9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd2E9Q5F9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd2E9Q5F9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd2E9Q5F9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd2E9Q5F9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd2E9Q5F9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd2E9Q5F9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setd2E9Q5F9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Setd2E9Q5F9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setd2E9Q5F9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setd2E9Q5F9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd2E9Q5F9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd2E9Q5F9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setd2E9Q5F9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setd2E9Q5F9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setd2E9Q5F9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd2E9Q5F9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd2E9Q5F9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd2E9Q5F9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd2E9Q5F9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd2E9Q5F9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd2E9Q5F9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd2E9Q5F9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd2E9Q5F9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd2E9Q5F9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd2E9Q5F9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd2E9Q5F9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd2E9Q5F9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd2E9Q5F9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setd2E9Q5F9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setd2E9Q5F9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setd2E9Q5F9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setd2E9Q5F9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setd2E9Q5F9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd2E9Q5F9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd2E9Q5F9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setd2E9Q5F9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setd2E9Q5F9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Setd2E9Q5F9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd2E9Q5F9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd2E9Q5F9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd2E9Q5F9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd2E9Q5F9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd2E9Q5F9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd2E9Q5F9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd2E9Q5F9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd2E9Q5F9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd2E9Q5F9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd2E9Q5F9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd2E9Q5F9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd2E9Q5F9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd2E9Q5F9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd2E9Q5F9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd2E9Q5F9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd2E9Q5F9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd2E9Q5F9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd2E9Q5F9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd2E9Q5F9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd2E9Q5F9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd2E9Q5F9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd2E9Q5F9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd2E9Q5F9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setd2E9Q5F9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setd2E9Q5F9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd2E9Q5F9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd2E9Q5F9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd2E9Q5F9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setd2E9Q5F9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setd2E9Q5F9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd2E9Q5F9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd2E9Q5F9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd2E9Q5F9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd2E9Q5F9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd2E9Q5F9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd2E9Q5F9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd2E9Q5F9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd2E9Q5F9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd2E9Q5F9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd2E9Q5F9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd2E9Q5F9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd2E9Q5F9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd2E9Q5F9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd2E9Q5F9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd2E9Q5F9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd2E9Q5F9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Setd2E9Q5F9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Setd2E9Q5F9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd2E9Q5F9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd2E9Q5F9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd2E9Q5F9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd2E9Q5F9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd2E9Q5F9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd2E9Q5F9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd2E9Q5F9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd2E9Q5F9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd2E9Q5F9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd2E9Q5F9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms