Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Pdzd2E9Q1M1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Pdzd2E9Q1M1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Pdzd2E9Q1M1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22,98■■□□□ 1,27
Pdzd2E9Q1M1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Pdzd2E9Q1M1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Pdzd2E9Q1M1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Pdzd2E9Q1M1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Pdzd2E9Q1M1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Pdzd2E9Q1M1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Pdzd2E9Q1M1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Pdzd2E9Q1M1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Pdzd2E9Q1M1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Pdzd2E9Q1M1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Pdzd2E9Q1M1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Pdzd2E9Q1M1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Pdzd2E9Q1M1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Pdzd2E9Q1M1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Pdzd2E9Q1M1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Pdzd2E9Q1M1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Pdzd2E9Q1M1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Pdzd2E9Q1M1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Pdzd2E9Q1M1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Pdzd2E9Q1M1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22,64■■□□□ 1,22
Pdzd2E9Q1M1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Pdzd2E9Q1M1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Pdzd2E9Q1M1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22,55■■□□□ 1,2
Pdzd2E9Q1M1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Pdzd2E9Q1M1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Pdzd2E9Q1M1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Pdzd2E9Q1M1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,52■■□□□ 1,2
Pdzd2E9Q1M1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Pdzd2E9Q1M1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22,51■■□□□ 1,19
Pdzd2E9Q1M1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Pdzd2E9Q1M1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Pdzd2E9Q1M1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Pdzd2E9Q1M1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22,48■■□□□ 1,19
Pdzd2E9Q1M1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Pdzd2E9Q1M1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22,44■■□□□ 1,18
Pdzd2E9Q1M1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Pdzd2E9Q1M1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22,44■■□□□ 1,18
Pdzd2E9Q1M1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Pdzd2E9Q1M1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Pdzd2E9Q1M1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Pdzd2E9Q1M1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,4■■□□□ 1,18
Pdzd2E9Q1M1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22,37■■□□□ 1,17
Pdzd2E9Q1M1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,36■■□□□ 1,17
Pdzd2E9Q1M1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,35■■□□□ 1,17
Pdzd2E9Q1M1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,34■■□□□ 1,17
Pdzd2E9Q1M1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
Pdzd2E9Q1M1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Pdzd2E9Q1M1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22,29■■□□□ 1,16
Pdzd2E9Q1M1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Pdzd2E9Q1M1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22,27■■□□□ 1,16
Pdzd2E9Q1M1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22,27■■□□□ 1,16
Pdzd2E9Q1M1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Pdzd2E9Q1M1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Pdzd2E9Q1M1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Pdzd2E9Q1M1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Pdzd2E9Q1M1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Pdzd2E9Q1M1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Pdzd2E9Q1M1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22,16■■□□□ 1,14
Pdzd2E9Q1M1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Pdzd2E9Q1M1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Pdzd2E9Q1M1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
Pdzd2E9Q1M1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Pdzd2E9Q1M1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Pdzd2E9Q1M1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Pdzd2E9Q1M1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Pdzd2E9Q1M1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,1■■□□□ 1,13
Pdzd2E9Q1M1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Pdzd2E9Q1M1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Pdzd2E9Q1M1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Pdzd2E9Q1M1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Pdzd2E9Q1M1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Pdzd2E9Q1M1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22,05■■□□□ 1,12
Pdzd2E9Q1M1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Pdzd2E9Q1M1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Pdzd2E9Q1M1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Pdzd2E9Q1M1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Pdzd2E9Q1M1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,97■■□□□ 1,11
Pdzd2E9Q1M1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21,97■■□□□ 1,11
Pdzd2E9Q1M1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Pdzd2E9Q1M1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21,95■■□□□ 1,1
Pdzd2E9Q1M1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Pdzd2E9Q1M1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21,93■■□□□ 1,1
Pdzd2E9Q1M1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Pdzd2E9Q1M1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21,93■■□□□ 1,1
Pdzd2E9Q1M1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Pdzd2E9Q1M1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Pdzd2E9Q1M1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Pdzd2E9Q1M1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21,88■■□□□ 1,09
Pdzd2E9Q1M1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Pdzd2E9Q1M1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Pdzd2E9Q1M1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Pdzd2E9Q1M1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Pdzd2E9Q1M1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
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