Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Cdr1E9Q0B4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Cdr1E9Q0B4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Cdr1E9Q0B4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Cdr1E9Q0B4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,74■■□□□ 1,87
Cdr1E9Q0B4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Cdr1E9Q0B4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Cdr1E9Q0B4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Cdr1E9Q0B4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Cdr1E9Q0B4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Cdr1E9Q0B4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Cdr1E9Q0B4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Cdr1E9Q0B4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Cdr1E9Q0B4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Cdr1E9Q0B4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Cdr1E9Q0B4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Cdr1E9Q0B4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,45■■□□□ 1,83
Cdr1E9Q0B4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Cdr1E9Q0B4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Cdr1E9Q0B4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Cdr1E9Q0B4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Cdr1E9Q0B4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Cdr1E9Q0B4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Cdr1E9Q0B4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Cdr1E9Q0B4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Cdr1E9Q0B4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Cdr1E9Q0B4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Cdr1E9Q0B4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Cdr1E9Q0B4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
Cdr1E9Q0B4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Cdr1E9Q0B4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Cdr1E9Q0B4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Cdr1E9Q0B4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Cdr1E9Q0B4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,16■■□□□ 1,78
Cdr1E9Q0B4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Cdr1E9Q0B4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Cdr1E9Q0B4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Cdr1E9Q0B4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Cdr1E9Q0B4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Cdr1E9Q0B4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Cdr1E9Q0B4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Cdr1E9Q0B4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Cdr1E9Q0B4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,98■■□□□ 1,75
Cdr1E9Q0B4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Cdr1E9Q0B4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Cdr1E9Q0B4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Cdr1E9Q0B4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Cdr1E9Q0B4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Cdr1E9Q0B4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Cdr1E9Q0B4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Cdr1E9Q0B4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Cdr1E9Q0B4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Cdr1E9Q0B4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Cdr1E9Q0B4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Cdr1E9Q0B4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Cdr1E9Q0B4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,89■■□□□ 1,73
Cdr1E9Q0B4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Cdr1E9Q0B4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Cdr1E9Q0B4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Cdr1E9Q0B4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Cdr1E9Q0B4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Cdr1E9Q0B4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Cdr1E9Q0B4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,8■■□□□ 1,72
Cdr1E9Q0B4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Cdr1E9Q0B4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Cdr1E9Q0B4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Cdr1E9Q0B4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Cdr1E9Q0B4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Cdr1E9Q0B4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Cdr1E9Q0B4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,73■■□□□ 1,71
Cdr1E9Q0B4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Cdr1E9Q0B4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Cdr1E9Q0B4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Cdr1E9Q0B4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Cdr1E9Q0B4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Cdr1E9Q0B4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Cdr1E9Q0B4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,63■■□□□ 1,69
Cdr1E9Q0B4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,63■■□□□ 1,69
Cdr1E9Q0B4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Cdr1E9Q0B4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Cdr1E9Q0B4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Cdr1E9Q0B4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Cdr1E9Q0B4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
Cdr1E9Q0B4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Cdr1E9Q0B4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Cdr1E9Q0B4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Cdr1E9Q0B4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Cdr1E9Q0B4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Cdr1E9Q0B4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Cdr1E9Q0B4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Cdr1E9Q0B4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Cdr1E9Q0B4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Cdr1E9Q0B4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Cdr1E9Q0B4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Cdr1E9Q0B4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Cdr1E9Q0B4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Cdr1E9Q0B4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Cdr1E9Q0B4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Cdr1E9Q0B4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Cdr1E9Q0B4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,3 ms