Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35,76■■■■□ 3,31
Ddx60E9PZQ1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Ddx60E9PZQ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35,73■■■■□ 3,31
Ddx60E9PZQ1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Ddx60E9PZQ1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,59■■■■□ 3,29
Ddx60E9PZQ1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,58■■■■□ 3,29
Ddx60E9PZQ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
Ddx60E9PZQ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35,54■■■■□ 3,28
Ddx60E9PZQ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35,44■■■■□ 3,26
Ddx60E9PZQ1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Ddx60E9PZQ1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Ddx60E9PZQ1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Ddx60E9PZQ1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Ddx60E9PZQ1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,31■■■■□ 3,24
Ddx60E9PZQ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Ddx60E9PZQ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Ddx60E9PZQ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35,18■■■■□ 3,22
Ddx60E9PZQ1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Ddx60E9PZQ1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35,16■■■■□ 3,22
Ddx60E9PZQ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Ddx60E9PZQ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Ddx60E9PZQ1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Ddx60E9PZQ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Ddx60E9PZQ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Ddx60E9PZQ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Ddx60E9PZQ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Ddx60E9PZQ1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,19
Ddx60E9PZQ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
Ddx60E9PZQ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
Ddx60E9PZQ1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,86■■■■□ 3,17
Ddx60E9PZQ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Ddx60E9PZQ1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,85■■■■□ 3,17
Ddx60E9PZQ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Ddx60E9PZQ1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,78■■■■□ 3,16
Ddx60E9PZQ1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,78■■■■□ 3,16
Ddx60E9PZQ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,75■■■■□ 3,15
Ddx60E9PZQ1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Ddx60E9PZQ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,7■■■■□ 3,15
Ddx60E9PZQ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Ddx60E9PZQ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,69■■■■□ 3,14
Ddx60E9PZQ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Ddx60E9PZQ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34,62■■■■□ 3,13
Ddx60E9PZQ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,62■■■■□ 3,13
Ddx60E9PZQ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,61■■■■□ 3,13
Ddx60E9PZQ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Ddx60E9PZQ1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Ddx60E9PZQ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Ddx60E9PZQ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,13
Ddx60E9PZQ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Ddx60E9PZQ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Ddx60E9PZQ1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,11
Ddx60E9PZQ1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34,49■■■■□ 3,11
Ddx60E9PZQ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Ddx60E9PZQ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Ddx60E9PZQ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Ddx60E9PZQ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Ddx60E9PZQ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Ddx60E9PZQ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Ddx60E9PZQ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Ddx60E9PZQ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Ddx60E9PZQ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,32■■■■□ 3,08
Ddx60E9PZQ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34,27■■■■□ 3,08
Ddx60E9PZQ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Ddx60E9PZQ1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Ddx60E9PZQ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Ddx60E9PZQ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Ddx60E9PZQ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Ddx60E9PZQ1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Ddx60E9PZQ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Ddx60E9PZQ1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Ddx60E9PZQ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Ddx60E9PZQ1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Ddx60E9PZQ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34,12■■■■□ 3,05
Ddx60E9PZQ1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Ddx60E9PZQ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Ddx60E9PZQ1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33,99■■■■□ 3,03
Ddx60E9PZQ1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Ddx60E9PZQ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Ddx60E9PZQ1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Ddx60E9PZQ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
Ddx60E9PZQ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Ddx60E9PZQ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Ddx60E9PZQ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33,88■■■■□ 3,01
Ddx60E9PZQ1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,84■■■■□ 3,01
Ddx60E9PZQ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Ddx60E9PZQ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Ddx60E9PZQ1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33,8■■■■□ 3
Ddx60E9PZQ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33,8■■■■□ 3
Ddx60E9PZQ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33,79■■■■□ 3
Ddx60E9PZQ1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,77■■■■□ 3
Ddx60E9PZQ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33,77■■■■□ 3
Ddx60E9PZQ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33,76■■■□□ 2,99
Ddx60E9PZQ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33,74■■■□□ 2,99
Ddx60E9PZQ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Ddx60E9PZQ1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Ddx60E9PZQ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Ddx60E9PZQ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Ddx60E9PZQ1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Ddx60E9PZQ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,65■■■□□ 2,98
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