Protein–RNA interactions for Protein: E9PVF1

Gm6904, Predicted gene 6904, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6904E9PVF1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm6904E9PVF1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm6904E9PVF1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm6904E9PVF1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6904E9PVF1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm6904E9PVF1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6904E9PVF1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6904E9PVF1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm6904E9PVF1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6904E9PVF1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm6904E9PVF1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6904E9PVF1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6904E9PVF1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6904E9PVF1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm6904E9PVF1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm6904E9PVF1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm6904E9PVF1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm6904E9PVF1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm6904E9PVF1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6904E9PVF1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6904E9PVF1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6904E9PVF1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm6904E9PVF1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6904E9PVF1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6904E9PVF1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6904E9PVF1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6904E9PVF1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6904E9PVF1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6904E9PVF1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6904E9PVF1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6904E9PVF1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6904E9PVF1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6904E9PVF1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6904E9PVF1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6904E9PVF1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6904E9PVF1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6904E9PVF1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm6904E9PVF1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm6904E9PVF1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm6904E9PVF1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm6904E9PVF1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6904E9PVF1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6904E9PVF1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6904E9PVF1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm6904E9PVF1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm6904E9PVF1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6904E9PVF1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm6904E9PVF1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm6904E9PVF1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm6904E9PVF1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm6904E9PVF1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm6904E9PVF1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm6904E9PVF1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm6904E9PVF1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm6904E9PVF1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm6904E9PVF1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm6904E9PVF1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm6904E9PVF1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm6904E9PVF1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm6904E9PVF1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm6904E9PVF1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm6904E9PVF1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm6904E9PVF1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm6904E9PVF1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm6904E9PVF1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm6904E9PVF1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm6904E9PVF1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm6904E9PVF1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm6904E9PVF1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm6904E9PVF1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm6904E9PVF1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm6904E9PVF1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm6904E9PVF1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm6904E9PVF1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm6904E9PVF1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm6904E9PVF1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm6904E9PVF1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm6904E9PVF1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm6904E9PVF1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6904E9PVF1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6904E9PVF1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6904E9PVF1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6904E9PVF1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6904E9PVF1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6904E9PVF1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6904E9PVF1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6904E9PVF1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6904E9PVF1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm6904E9PVF1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm6904E9PVF1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6904E9PVF1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6904E9PVF1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6904E9PVF1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6904E9PVF1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6904E9PVF1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6904E9PVF1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6904E9PVF1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6904E9PVF1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm6904E9PVF1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6904E9PVF1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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