Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx6-2D3Z4R4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx6-2D3Z4R4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx6-2D3Z4R4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx6-2D3Z4R4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx6-2D3Z4R4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx6-2D3Z4R4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx6-2D3Z4R4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx6-2D3Z4R4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx6-2D3Z4R4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx6-2D3Z4R4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx6-2D3Z4R4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx6-2D3Z4R4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx6-2D3Z4R4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx6-2D3Z4R4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx6-2D3Z4R4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx6-2D3Z4R4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx6-2D3Z4R4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx6-2D3Z4R4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx6-2D3Z4R4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx6-2D3Z4R4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx6-2D3Z4R4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx6-2D3Z4R4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx6-2D3Z4R4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx6-2D3Z4R4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx6-2D3Z4R4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx6-2D3Z4R4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx6-2D3Z4R4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx6-2D3Z4R4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nkx6-2D3Z4R4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx6-2D3Z4R4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx6-2D3Z4R4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx6-2D3Z4R4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx6-2D3Z4R4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx6-2D3Z4R4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx6-2D3Z4R4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx6-2D3Z4R4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx6-2D3Z4R4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx6-2D3Z4R4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx6-2D3Z4R4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx6-2D3Z4R4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx6-2D3Z4R4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx6-2D3Z4R4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx6-2D3Z4R4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx6-2D3Z4R4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx6-2D3Z4R4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx6-2D3Z4R4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx6-2D3Z4R4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx6-2D3Z4R4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx6-2D3Z4R4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx6-2D3Z4R4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx6-2D3Z4R4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx6-2D3Z4R4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx6-2D3Z4R4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx6-2D3Z4R4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx6-2D3Z4R4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx6-2D3Z4R4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx6-2D3Z4R4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx6-2D3Z4R4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx6-2D3Z4R4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx6-2D3Z4R4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx6-2D3Z4R4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx6-2D3Z4R4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx6-2D3Z4R4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx6-2D3Z4R4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx6-2D3Z4R4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx6-2D3Z4R4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx6-2D3Z4R4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx6-2D3Z4R4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx6-2D3Z4R4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx6-2D3Z4R4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx6-2D3Z4R4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx6-2D3Z4R4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx6-2D3Z4R4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms