Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

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Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Nkx6-2D3Z4R4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,13■■□□□ 1,13
Nkx6-2D3Z4R4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Nkx6-2D3Z4R4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,1■■□□□ 1,13
Nkx6-2D3Z4R4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Nkx6-2D3Z4R4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Nkx6-2D3Z4R4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Nkx6-2D3Z4R4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Nkx6-2D3Z4R4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Nkx6-2D3Z4R4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,97■■□□□ 1,11
Nkx6-2D3Z4R4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21,94■■□□□ 1,1
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Nkx6-2D3Z4R4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Nkx6-2D3Z4R4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Nkx6-2D3Z4R4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,86■■□□□ 1,09
Nkx6-2D3Z4R4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Nkx6-2D3Z4R4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Nkx6-2D3Z4R4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Nkx6-2D3Z4R4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Nkx6-2D3Z4R4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Nkx6-2D3Z4R4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Nkx6-2D3Z4R4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Nkx6-2D3Z4R4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Nkx6-2D3Z4R4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Nkx6-2D3Z4R4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Nkx6-2D3Z4R4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Nkx6-2D3Z4R4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Nkx6-2D3Z4R4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Nkx6-2D3Z4R4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21,65■■□□□ 1,06
Nkx6-2D3Z4R4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Nkx6-2D3Z4R4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Nkx6-2D3Z4R4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Nkx6-2D3Z4R4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Nkx6-2D3Z4R4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Nkx6-2D3Z4R4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21,58■■□□□ 1,05
Nkx6-2D3Z4R4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Nkx6-2D3Z4R4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Nkx6-2D3Z4R4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21,53■■□□□ 1,04
Nkx6-2D3Z4R4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Nkx6-2D3Z4R4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Nkx6-2D3Z4R4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21,51■■□□□ 1,03
Nkx6-2D3Z4R4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Nkx6-2D3Z4R4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Nkx6-2D3Z4R4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Nkx6-2D3Z4R4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Nkx6-2D3Z4R4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Nkx6-2D3Z4R4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,45■■□□□ 1,02
Nkx6-2D3Z4R4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Nkx6-2D3Z4R4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Nkx6-2D3Z4R4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Nkx6-2D3Z4R4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Nkx6-2D3Z4R4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Nkx6-2D3Z4R4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Nkx6-2D3Z4R4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Nkx6-2D3Z4R4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Nkx6-2D3Z4R4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Nkx6-2D3Z4R4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,35■■□□□ 1,01
Nkx6-2D3Z4R4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21,34■■□□□ 1,01
Nkx6-2D3Z4R4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Nkx6-2D3Z4R4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,32■■□□□ 1
Nkx6-2D3Z4R4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Nkx6-2D3Z4R4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21,29■■□□□ 1
Nkx6-2D3Z4R4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Nkx6-2D3Z4R4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21,26■□□□□ 0,99
Nkx6-2D3Z4R4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Nkx6-2D3Z4R4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Nkx6-2D3Z4R4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Nkx6-2D3Z4R4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Nkx6-2D3Z4R4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Nkx6-2D3Z4R4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Nkx6-2D3Z4R4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Nkx6-2D3Z4R4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Nkx6-2D3Z4R4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Nkx6-2D3Z4R4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Nkx6-2D3Z4R4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Nkx6-2D3Z4R4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Nkx6-2D3Z4R4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Nkx6-2D3Z4R4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21,19■□□□□ 0,98
Nkx6-2D3Z4R4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Nkx6-2D3Z4R4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Nkx6-2D3Z4R4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21,17■□□□□ 0,98
Nkx6-2D3Z4R4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Nkx6-2D3Z4R4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Nkx6-2D3Z4R4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Nkx6-2D3Z4R4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Nkx6-2D3Z4R4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Nkx6-2D3Z4R4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
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