Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Apol6B7ZC55 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Apol6B7ZC55 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
Apol6B7ZC55 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Apol6B7ZC55 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Apol6B7ZC55 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Apol6B7ZC55 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Apol6B7ZC55 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Apol6B7ZC55 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Apol6B7ZC55 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Apol6B7ZC55 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Apol6B7ZC55 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Apol6B7ZC55 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Apol6B7ZC55 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Apol6B7ZC55 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Apol6B7ZC55 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Apol6B7ZC55 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Apol6B7ZC55 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,58■■■□□ 2,33
Apol6B7ZC55 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Apol6B7ZC55 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Apol6B7ZC55 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Apol6B7ZC55 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Apol6B7ZC55 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
Apol6B7ZC55 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Apol6B7ZC55 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Apol6B7ZC55 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Apol6B7ZC55 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Apol6B7ZC55 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Apol6B7ZC55 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,37■■■□□ 2,29
Apol6B7ZC55 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Apol6B7ZC55 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Apol6B7ZC55 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Apol6B7ZC55 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Apol6B7ZC55 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Apol6B7ZC55 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Apol6B7ZC55 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Apol6B7ZC55 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Apol6B7ZC55 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Apol6B7ZC55 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
Apol6B7ZC55 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Apol6B7ZC55 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Apol6B7ZC55 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Apol6B7ZC55 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Apol6B7ZC55 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Apol6B7ZC55 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Apol6B7ZC55 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Apol6B7ZC55 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Apol6B7ZC55 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Apol6B7ZC55 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Apol6B7ZC55 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Apol6B7ZC55 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Apol6B7ZC55 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Apol6B7ZC55 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Apol6B7ZC55 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Apol6B7ZC55 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Apol6B7ZC55 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Apol6B7ZC55 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Apol6B7ZC55 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Apol6B7ZC55 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Apol6B7ZC55 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Apol6B7ZC55 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Apol6B7ZC55 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Apol6B7ZC55 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Apol6B7ZC55 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Apol6B7ZC55 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Apol6B7ZC55 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,87■■■□□ 2,21
Apol6B7ZC55 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Apol6B7ZC55 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Apol6B7ZC55 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Apol6B7ZC55 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Apol6B7ZC55 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Apol6B7ZC55 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Apol6B7ZC55 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,79■■■□□ 2,2
Apol6B7ZC55 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Apol6B7ZC55 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Apol6B7ZC55 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Apol6B7ZC55 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Apol6B7ZC55 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Apol6B7ZC55 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Apol6B7ZC55 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Apol6B7ZC55 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Apol6B7ZC55 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Apol6B7ZC55 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Apol6B7ZC55 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Apol6B7ZC55 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Apol6B7ZC55 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Apol6B7ZC55 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Apol6B7ZC55 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Apol6B7ZC55 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Apol6B7ZC55 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Apol6B7ZC55 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Apol6B7ZC55 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Apol6B7ZC55 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Apol6B7ZC55 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Apol6B7ZC55 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Apol6B7ZC55 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Apol6B7ZC55 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Apol6B7ZC55 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Apol6B7ZC55 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Apol6B7ZC55 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms