Protein–RNA interactions for Protein: B5THE2

Mgam, Maltase-glucoamylase, mousemouse

Predictions only

Length 1,827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MgamB5THE2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,35■■■□□ 2,29
MgamB5THE2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
MgamB5THE2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,28■■■□□ 2,28
MgamB5THE2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
MgamB5THE2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
MgamB5THE2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
MgamB5THE2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
MgamB5THE2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
MgamB5THE2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
MgamB5THE2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
MgamB5THE2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
MgamB5THE2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
MgamB5THE2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
MgamB5THE2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
MgamB5THE2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
MgamB5THE2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,89■■■□□ 2,21
MgamB5THE2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
MgamB5THE2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
MgamB5THE2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
MgamB5THE2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
MgamB5THE2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
MgamB5THE2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
MgamB5THE2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
MgamB5THE2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
MgamB5THE2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
MgamB5THE2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
MgamB5THE2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,69■■■□□ 2,18
MgamB5THE2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
MgamB5THE2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
MgamB5THE2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
MgamB5THE2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
MgamB5THE2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,64■■■□□ 2,17
MgamB5THE2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
MgamB5THE2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
MgamB5THE2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,6■■■□□ 2,17
MgamB5THE2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
MgamB5THE2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,54■■■□□ 2,16
MgamB5THE2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
MgamB5THE2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
MgamB5THE2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
MgamB5THE2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
MgamB5THE2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
MgamB5THE2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
MgamB5THE2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,45■■■□□ 2,14
MgamB5THE2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
MgamB5THE2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
MgamB5THE2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,39■■■□□ 2,14
MgamB5THE2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
MgamB5THE2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
MgamB5THE2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
MgamB5THE2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
MgamB5THE2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
MgamB5THE2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
MgamB5THE2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
MgamB5THE2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
MgamB5THE2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
MgamB5THE2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
MgamB5THE2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
MgamB5THE2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
MgamB5THE2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
MgamB5THE2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,16■■■□□ 2,1
MgamB5THE2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
MgamB5THE2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
MgamB5THE2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,09■■■□□ 2,09
MgamB5THE2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
MgamB5THE2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
MgamB5THE2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
MgamB5THE2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
MgamB5THE2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
MgamB5THE2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
MgamB5THE2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
MgamB5THE2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
MgamB5THE2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
MgamB5THE2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
MgamB5THE2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
MgamB5THE2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
MgamB5THE2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,89■■■□□ 2,06
MgamB5THE2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
MgamB5THE2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
MgamB5THE2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
MgamB5THE2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
MgamB5THE2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
MgamB5THE2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
MgamB5THE2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
MgamB5THE2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27,76■■■□□ 2,04
MgamB5THE2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
MgamB5THE2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
MgamB5THE2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
MgamB5THE2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
MgamB5THE2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
MgamB5THE2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
MgamB5THE2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
MgamB5THE2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
MgamB5THE2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
MgamB5THE2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
MgamB5THE2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
MgamB5THE2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,64■■■□□ 2,02
MgamB5THE2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
MgamB5THE2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
MgamB5THE2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms