Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Gm5483B2RV77 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Gm5483B2RV77 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Gm5483B2RV77 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Gm5483B2RV77 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Gm5483B2RV77 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Gm5483B2RV77 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Gm5483B2RV77 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Gm5483B2RV77 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Gm5483B2RV77 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Gm5483B2RV77 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Gm5483B2RV77 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Gm5483B2RV77 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Gm5483B2RV77 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Gm5483B2RV77 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
Gm5483B2RV77 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Gm5483B2RV77 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Gm5483B2RV77 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Gm5483B2RV77 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Gm5483B2RV77 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Gm5483B2RV77 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Gm5483B2RV77 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Gm5483B2RV77 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Gm5483B2RV77 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Gm5483B2RV77 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,89■■■□□ 2,22
Gm5483B2RV77 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Gm5483B2RV77 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Gm5483B2RV77 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Gm5483B2RV77 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Gm5483B2RV77 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Gm5483B2RV77 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Gm5483B2RV77 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,64■■■□□ 2,17
Gm5483B2RV77 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Gm5483B2RV77 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Gm5483B2RV77 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Gm5483B2RV77 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Gm5483B2RV77 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Gm5483B2RV77 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Gm5483B2RV77 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Gm5483B2RV77 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Gm5483B2RV77 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Gm5483B2RV77 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Gm5483B2RV77 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Gm5483B2RV77 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Gm5483B2RV77 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Gm5483B2RV77 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Gm5483B2RV77 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Gm5483B2RV77 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Gm5483B2RV77 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Gm5483B2RV77 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Gm5483B2RV77 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Gm5483B2RV77 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Gm5483B2RV77 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,39■■■□□ 2,13
Gm5483B2RV77 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Gm5483B2RV77 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Gm5483B2RV77 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Gm5483B2RV77 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Gm5483B2RV77 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Gm5483B2RV77 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Gm5483B2RV77 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Gm5483B2RV77 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Gm5483B2RV77 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Gm5483B2RV77 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Gm5483B2RV77 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Gm5483B2RV77 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Gm5483B2RV77 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Gm5483B2RV77 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Gm5483B2RV77 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Gm5483B2RV77 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Gm5483B2RV77 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Gm5483B2RV77 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Gm5483B2RV77 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Gm5483B2RV77 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Gm5483B2RV77 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Gm5483B2RV77 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Gm5483B2RV77 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Gm5483B2RV77 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Gm5483B2RV77 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Gm5483B2RV77 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Gm5483B2RV77 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Gm5483B2RV77 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Gm5483B2RV77 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Gm5483B2RV77 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Gm5483B2RV77 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Gm5483B2RV77 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Gm5483B2RV77 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Gm5483B2RV77 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Gm5483B2RV77 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Gm5483B2RV77 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Gm5483B2RV77 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Gm5483B2RV77 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Gm5483B2RV77 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Gm5483B2RV77 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Gm5483B2RV77 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Gm5483B2RV77 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Gm5483B2RV77 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
Gm5483B2RV77 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Gm5483B2RV77 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27,67■■■□□ 2,02
Gm5483B2RV77 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Gm5483B2RV77 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms