Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
JrklB2RRL2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
JrklB2RRL2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
JrklB2RRL2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
JrklB2RRL2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
JrklB2RRL2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
JrklB2RRL2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
JrklB2RRL2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
JrklB2RRL2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
JrklB2RRL2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
JrklB2RRL2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
JrklB2RRL2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
JrklB2RRL2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
JrklB2RRL2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
JrklB2RRL2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
JrklB2RRL2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
JrklB2RRL2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
JrklB2RRL2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
JrklB2RRL2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
JrklB2RRL2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
JrklB2RRL2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
JrklB2RRL2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
JrklB2RRL2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
JrklB2RRL2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
JrklB2RRL2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
JrklB2RRL2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
JrklB2RRL2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
JrklB2RRL2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
JrklB2RRL2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
JrklB2RRL2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
JrklB2RRL2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
JrklB2RRL2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
JrklB2RRL2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
JrklB2RRL2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
JrklB2RRL2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
JrklB2RRL2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
JrklB2RRL2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
JrklB2RRL2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
JrklB2RRL2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
JrklB2RRL2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
JrklB2RRL2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
JrklB2RRL2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
JrklB2RRL2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
JrklB2RRL2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
JrklB2RRL2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
JrklB2RRL2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
JrklB2RRL2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
JrklB2RRL2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
JrklB2RRL2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
JrklB2RRL2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
JrklB2RRL2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
JrklB2RRL2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
JrklB2RRL2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
JrklB2RRL2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
JrklB2RRL2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
JrklB2RRL2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
JrklB2RRL2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
JrklB2RRL2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
JrklB2RRL2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
JrklB2RRL2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
JrklB2RRL2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
JrklB2RRL2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
JrklB2RRL2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
JrklB2RRL2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
JrklB2RRL2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
JrklB2RRL2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
JrklB2RRL2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
JrklB2RRL2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
JrklB2RRL2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
JrklB2RRL2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
JrklB2RRL2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
JrklB2RRL2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
JrklB2RRL2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
JrklB2RRL2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
JrklB2RRL2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
JrklB2RRL2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
JrklB2RRL2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
JrklB2RRL2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
JrklB2RRL2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
JrklB2RRL2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
JrklB2RRL2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
JrklB2RRL2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
JrklB2RRL2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
JrklB2RRL2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
JrklB2RRL2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
JrklB2RRL2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
JrklB2RRL2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
JrklB2RRL2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
JrklB2RRL2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
JrklB2RRL2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
JrklB2RRL2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
JrklB2RRL2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
JrklB2RRL2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
JrklB2RRL2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
JrklB2RRL2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
JrklB2RRL2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
JrklB2RRL2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
JrklB2RRL2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
JrklB2RRL2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
JrklB2RRL2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms