Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
AU022751B1B0V2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
AU022751B1B0V2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC40.02■■■■■ 4
AU022751B1B0V2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
AU022751B1B0V2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC40.01■■■■■ 4
AU022751B1B0V2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
AU022751B1B0V2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
AU022751B1B0V2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
AU022751B1B0V2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
AU022751B1B0V2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
AU022751B1B0V2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
AU022751B1B0V2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
AU022751B1B0V2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
AU022751B1B0V2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
AU022751B1B0V2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
AU022751B1B0V2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
AU022751B1B0V2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
AU022751B1B0V2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
AU022751B1B0V2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
AU022751B1B0V2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
AU022751B1B0V2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
AU022751B1B0V2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
AU022751B1B0V2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
AU022751B1B0V2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
AU022751B1B0V2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
AU022751B1B0V2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
AU022751B1B0V2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC39.26■■■■□ 3.87
AU022751B1B0V2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
AU022751B1B0V2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
AU022751B1B0V2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
AU022751B1B0V2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
AU022751B1B0V2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
AU022751B1B0V2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
AU022751B1B0V2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
AU022751B1B0V2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
AU022751B1B0V2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
AU022751B1B0V2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
AU022751B1B0V2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
AU022751B1B0V2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
AU022751B1B0V2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
AU022751B1B0V2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
AU022751B1B0V2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
AU022751B1B0V2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
AU022751B1B0V2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
AU022751B1B0V2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
AU022751B1B0V2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
AU022751B1B0V2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
AU022751B1B0V2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
AU022751B1B0V2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
AU022751B1B0V2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
AU022751B1B0V2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
AU022751B1B0V2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
AU022751B1B0V2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
AU022751B1B0V2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
AU022751B1B0V2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
AU022751B1B0V2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
AU022751B1B0V2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
AU022751B1B0V2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
AU022751B1B0V2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
AU022751B1B0V2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
AU022751B1B0V2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
AU022751B1B0V2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
AU022751B1B0V2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
AU022751B1B0V2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
AU022751B1B0V2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
AU022751B1B0V2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
AU022751B1B0V2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
AU022751B1B0V2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
AU022751B1B0V2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
AU022751B1B0V2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
AU022751B1B0V2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
AU022751B1B0V2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
AU022751B1B0V2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
AU022751B1B0V2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
AU022751B1B0V2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
AU022751B1B0V2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
AU022751B1B0V2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
AU022751B1B0V2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
AU022751B1B0V2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
AU022751B1B0V2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
AU022751B1B0V2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
AU022751B1B0V2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
AU022751B1B0V2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
AU022751B1B0V2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
AU022751B1B0V2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
AU022751B1B0V2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
AU022751B1B0V2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
AU022751B1B0V2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
AU022751B1B0V2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
AU022751B1B0V2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC38■■■■□ 3.67
AU022751B1B0V2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
AU022751B1B0V2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
AU022751B1B0V2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
AU022751B1B0V2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
AU022751B1B0V2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
AU022751B1B0V2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
AU022751B1B0V2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
AU022751B1B0V2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
AU022751B1B0V2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
AU022751B1B0V2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms