Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU7

Gm13178, Predicted gene 13178, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13178B1AVU7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm13178B1AVU7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm13178B1AVU7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm13178B1AVU7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm13178B1AVU7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm13178B1AVU7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm13178B1AVU7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm13178B1AVU7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm13178B1AVU7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm13178B1AVU7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm13178B1AVU7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm13178B1AVU7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm13178B1AVU7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm13178B1AVU7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm13178B1AVU7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm13178B1AVU7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm13178B1AVU7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm13178B1AVU7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm13178B1AVU7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm13178B1AVU7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm13178B1AVU7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm13178B1AVU7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm13178B1AVU7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm13178B1AVU7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm13178B1AVU7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm13178B1AVU7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm13178B1AVU7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm13178B1AVU7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm13178B1AVU7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm13178B1AVU7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm13178B1AVU7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm13178B1AVU7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm13178B1AVU7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm13178B1AVU7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm13178B1AVU7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm13178B1AVU7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm13178B1AVU7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm13178B1AVU7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm13178B1AVU7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm13178B1AVU7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm13178B1AVU7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm13178B1AVU7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm13178B1AVU7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm13178B1AVU7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm13178B1AVU7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm13178B1AVU7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm13178B1AVU7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm13178B1AVU7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm13178B1AVU7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm13178B1AVU7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm13178B1AVU7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm13178B1AVU7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm13178B1AVU7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm13178B1AVU7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm13178B1AVU7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm13178B1AVU7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm13178B1AVU7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm13178B1AVU7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm13178B1AVU7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm13178B1AVU7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm13178B1AVU7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm13178B1AVU7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm13178B1AVU7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm13178B1AVU7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm13178B1AVU7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm13178B1AVU7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm13178B1AVU7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm13178B1AVU7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm13178B1AVU7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm13178B1AVU7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm13178B1AVU7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm13178B1AVU7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm13178B1AVU7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm13178B1AVU7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm13178B1AVU7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm13178B1AVU7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm13178B1AVU7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm13178B1AVU7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm13178B1AVU7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm13178B1AVU7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm13178B1AVU7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm13178B1AVU7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm13178B1AVU7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm13178B1AVU7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm13178B1AVU7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm13178B1AVU7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm13178B1AVU7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm13178B1AVU7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm13178B1AVU7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm13178B1AVU7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm13178B1AVU7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm13178B1AVU7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm13178B1AVU7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm13178B1AVU7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm13178B1AVU7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm13178B1AVU7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm13178B1AVU7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm13178B1AVU7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm13178B1AVU7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm13178B1AVU7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms