Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AgrnA2ASQ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AgrnA2ASQ1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AgrnA2ASQ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AgrnA2ASQ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AgrnA2ASQ1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AgrnA2ASQ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AgrnA2ASQ1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AgrnA2ASQ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AgrnA2ASQ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AgrnA2ASQ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AgrnA2ASQ1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AgrnA2ASQ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AgrnA2ASQ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AgrnA2ASQ1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AgrnA2ASQ1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AgrnA2ASQ1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
AgrnA2ASQ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AgrnA2ASQ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AgrnA2ASQ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AgrnA2ASQ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AgrnA2ASQ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AgrnA2ASQ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AgrnA2ASQ1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AgrnA2ASQ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AgrnA2ASQ1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AgrnA2ASQ1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AgrnA2ASQ1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AgrnA2ASQ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AgrnA2ASQ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AgrnA2ASQ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AgrnA2ASQ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AgrnA2ASQ1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AgrnA2ASQ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
AgrnA2ASQ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AgrnA2ASQ1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AgrnA2ASQ1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
AgrnA2ASQ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
AgrnA2ASQ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AgrnA2ASQ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AgrnA2ASQ1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AgrnA2ASQ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
AgrnA2ASQ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AgrnA2ASQ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AgrnA2ASQ1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AgrnA2ASQ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AgrnA2ASQ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AgrnA2ASQ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AgrnA2ASQ1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AgrnA2ASQ1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AgrnA2ASQ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
AgrnA2ASQ1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AgrnA2ASQ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AgrnA2ASQ1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
AgrnA2ASQ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AgrnA2ASQ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
AgrnA2ASQ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AgrnA2ASQ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AgrnA2ASQ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AgrnA2ASQ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AgrnA2ASQ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AgrnA2ASQ1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AgrnA2ASQ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AgrnA2ASQ1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AgrnA2ASQ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AgrnA2ASQ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AgrnA2ASQ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AgrnA2ASQ1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AgrnA2ASQ1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
AgrnA2ASQ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AgrnA2ASQ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AgrnA2ASQ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AgrnA2ASQ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AgrnA2ASQ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AgrnA2ASQ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AgrnA2ASQ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AgrnA2ASQ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AgrnA2ASQ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AgrnA2ASQ1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AgrnA2ASQ1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AgrnA2ASQ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AgrnA2ASQ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AgrnA2ASQ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AgrnA2ASQ1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AgrnA2ASQ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AgrnA2ASQ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AgrnA2ASQ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AgrnA2ASQ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AgrnA2ASQ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AgrnA2ASQ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AgrnA2ASQ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AgrnA2ASQ1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AgrnA2ASQ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AgrnA2ASQ1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AgrnA2ASQ1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AgrnA2ASQ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AgrnA2ASQ1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AgrnA2ASQ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AgrnA2ASQ1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AgrnA2ASQ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
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