Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT7

Vmn1r3, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r3A2AMT7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Vmn1r3A2AMT7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Vmn1r3A2AMT7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Vmn1r3A2AMT7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Vmn1r3A2AMT7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Vmn1r3A2AMT7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Vmn1r3A2AMT7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Vmn1r3A2AMT7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Vmn1r3A2AMT7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Vmn1r3A2AMT7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Vmn1r3A2AMT7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Vmn1r3A2AMT7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Vmn1r3A2AMT7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Vmn1r3A2AMT7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,17■■□□□ 1,78
Vmn1r3A2AMT7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Vmn1r3A2AMT7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Vmn1r3A2AMT7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Vmn1r3A2AMT7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Vmn1r3A2AMT7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Vmn1r3A2AMT7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,11■■□□□ 1,77
Vmn1r3A2AMT7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Vmn1r3A2AMT7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Vmn1r3A2AMT7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Vmn1r3A2AMT7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Vmn1r3A2AMT7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Vmn1r3A2AMT7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Vmn1r3A2AMT7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Vmn1r3A2AMT7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Vmn1r3A2AMT7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Vmn1r3A2AMT7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Vmn1r3A2AMT7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Vmn1r3A2AMT7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
Vmn1r3A2AMT7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Vmn1r3A2AMT7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Vmn1r3A2AMT7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Vmn1r3A2AMT7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Vmn1r3A2AMT7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Vmn1r3A2AMT7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Vmn1r3A2AMT7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Vmn1r3A2AMT7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Vmn1r3A2AMT7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Vmn1r3A2AMT7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Vmn1r3A2AMT7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Vmn1r3A2AMT7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Vmn1r3A2AMT7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Vmn1r3A2AMT7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Vmn1r3A2AMT7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Vmn1r3A2AMT7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Vmn1r3A2AMT7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Vmn1r3A2AMT7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
Vmn1r3A2AMT7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Vmn1r3A2AMT7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Vmn1r3A2AMT7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Vmn1r3A2AMT7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
Vmn1r3A2AMT7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Vmn1r3A2AMT7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Vmn1r3A2AMT7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Vmn1r3A2AMT7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Vmn1r3A2AMT7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Vmn1r3A2AMT7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Vmn1r3A2AMT7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Vmn1r3A2AMT7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Vmn1r3A2AMT7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Vmn1r3A2AMT7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Vmn1r3A2AMT7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
Vmn1r3A2AMT7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Vmn1r3A2AMT7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Vmn1r3A2AMT7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Vmn1r3A2AMT7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Vmn1r3A2AMT7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Vmn1r3A2AMT7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Vmn1r3A2AMT7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Vmn1r3A2AMT7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Vmn1r3A2AMT7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Vmn1r3A2AMT7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Vmn1r3A2AMT7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Vmn1r3A2AMT7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Vmn1r3A2AMT7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,64
Vmn1r3A2AMT7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Vmn1r3A2AMT7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Vmn1r3A2AMT7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Vmn1r3A2AMT7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Vmn1r3A2AMT7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Vmn1r3A2AMT7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
Vmn1r3A2AMT7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Vmn1r3A2AMT7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Vmn1r3A2AMT7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Vmn1r3A2AMT7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Vmn1r3A2AMT7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Vmn1r3A2AMT7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Vmn1r3A2AMT7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Vmn1r3A2AMT7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Vmn1r3A2AMT7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Vmn1r3A2AMT7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Vmn1r3A2AMT7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Vmn1r3A2AMT7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Vmn1r3A2AMT7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Vmn1r3A2AMT7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Vmn1r3A2AMT7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Vmn1r3A2AMT7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,1 ms