Protein–RNA interactions for Protein: A2AF28

Slc25a53, MCG115034, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a53A2AF28 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc25a53A2AF28 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc25a53A2AF28 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc25a53A2AF28 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc25a53A2AF28 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc25a53A2AF28 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc25a53A2AF28 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc25a53A2AF28 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc25a53A2AF28 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc25a53A2AF28 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc25a53A2AF28 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc25a53A2AF28 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc25a53A2AF28 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc25a53A2AF28 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc25a53A2AF28 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc25a53A2AF28 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc25a53A2AF28 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc25a53A2AF28 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc25a53A2AF28 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc25a53A2AF28 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc25a53A2AF28 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc25a53A2AF28 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc25a53A2AF28 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc25a53A2AF28 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc25a53A2AF28 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc25a53A2AF28 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc25a53A2AF28 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc25a53A2AF28 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc25a53A2AF28 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc25a53A2AF28 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc25a53A2AF28 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc25a53A2AF28 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc25a53A2AF28 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc25a53A2AF28 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc25a53A2AF28 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc25a53A2AF28 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc25a53A2AF28 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc25a53A2AF28 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc25a53A2AF28 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc25a53A2AF28 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc25a53A2AF28 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc25a53A2AF28 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc25a53A2AF28 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc25a53A2AF28 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc25a53A2AF28 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc25a53A2AF28 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc25a53A2AF28 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc25a53A2AF28 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc25a53A2AF28 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc25a53A2AF28 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc25a53A2AF28 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc25a53A2AF28 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc25a53A2AF28 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc25a53A2AF28 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc25a53A2AF28 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc25a53A2AF28 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc25a53A2AF28 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc25a53A2AF28 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc25a53A2AF28 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc25a53A2AF28 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc25a53A2AF28 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc25a53A2AF28 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc25a53A2AF28 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc25a53A2AF28 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc25a53A2AF28 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc25a53A2AF28 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc25a53A2AF28 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc25a53A2AF28 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc25a53A2AF28 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc25a53A2AF28 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc25a53A2AF28 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc25a53A2AF28 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc25a53A2AF28 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc25a53A2AF28 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc25a53A2AF28 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc25a53A2AF28 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc25a53A2AF28 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc25a53A2AF28 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc25a53A2AF28 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc25a53A2AF28 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc25a53A2AF28 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc25a53A2AF28 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc25a53A2AF28 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc25a53A2AF28 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc25a53A2AF28 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc25a53A2AF28 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc25a53A2AF28 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc25a53A2AF28 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc25a53A2AF28 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc25a53A2AF28 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc25a53A2AF28 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc25a53A2AF28 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc25a53A2AF28 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc25a53A2AF28 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc25a53A2AF28 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc25a53A2AF28 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc25a53A2AF28 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc25a53A2AF28 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc25a53A2AF28 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc25a53A2AF28 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms