Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,15■■■■■ 4,18
Myom3A2ABU4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC41,06■■■■■ 4,16
Myom3A2ABU4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,04■■■■■ 4,16
Myom3A2ABU4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,03■■■■■ 4,16
Myom3A2ABU4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,02■■■■■ 4,16
Myom3A2ABU4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC40,99■■■■■ 4,15
Myom3A2ABU4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC40,99■■■■■ 4,15
Myom3A2ABU4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
Myom3A2ABU4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
Myom3A2ABU4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC40,88■■■■■ 4,14
Myom3A2ABU4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,86■■■■■ 4,13
Myom3A2ABU4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,78■■■■■ 4,12
Myom3A2ABU4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,76■■■■■ 4,12
Myom3A2ABU4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,72■■■■■ 4,11
Myom3A2ABU4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC40,7■■■■■ 4,11
Myom3A2ABU4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40,67■■■■■ 4,1
Myom3A2ABU4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,67■■■■■ 4,1
Myom3A2ABU4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,61■■■■■ 4,09
Myom3A2ABU4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40,54■■■■■ 4,08
Myom3A2ABU4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
Myom3A2ABU4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Myom3A2ABU4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC40,41■■■■■ 4,06
Myom3A2ABU4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40,4■■■■■ 4,06
Myom3A2ABU4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,36■■■■■ 4,05
Myom3A2ABU4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,34■■■■■ 4,05
Myom3A2ABU4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,32■■■■■ 4,04
Myom3A2ABU4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,3■■■■■ 4,04
Myom3A2ABU4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC40,27■■■■■ 4,04
Myom3A2ABU4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC40,21■■■■■ 4,03
Myom3A2ABU4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC40,19■■■■■ 4,02
Myom3A2ABU4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40,04■■■■■ 4
Myom3A2ABU4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,04■■■■■ 4
Myom3A2ABU4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3,99
Myom3A2ABU4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
Myom3A2ABU4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
Myom3A2ABU4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC39,98■■■■□ 3,99
Myom3A2ABU4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,96■■■■□ 3,99
Myom3A2ABU4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC39,95■■■■□ 3,99
Myom3A2ABU4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,91■■■■□ 3,98
Myom3A2ABU4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC39,9■■■■□ 3,98
Myom3A2ABU4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,97
Myom3A2ABU4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,87■■■■□ 3,97
Myom3A2ABU4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39,87■■■■□ 3,97
Myom3A2ABU4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC39,84■■■■□ 3,97
Myom3A2ABU4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,82■■■■□ 3,96
Myom3A2ABU4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC39,82■■■■□ 3,96
Myom3A2ABU4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC39,81■■■■□ 3,96
Myom3A2ABU4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,81■■■■□ 3,96
Myom3A2ABU4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,79■■■■□ 3,96
Myom3A2ABU4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,79■■■■□ 3,96
Myom3A2ABU4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC39,78■■■■□ 3,96
Myom3A2ABU4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,77■■■■□ 3,96
Myom3A2ABU4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC39,65■■■■□ 3,94
Myom3A2ABU4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,93
Myom3A2ABU4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,93
Myom3A2ABU4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,62■■■■□ 3,93
Myom3A2ABU4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39,59■■■■□ 3,93
Myom3A2ABU4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC39,57■■■■□ 3,92
Myom3A2ABU4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,52■■■■□ 3,92
Myom3A2ABU4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,51■■■■□ 3,91
Myom3A2ABU4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC39,49■■■■□ 3,91
Myom3A2ABU4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Myom3A2ABU4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Myom3A2ABU4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
Myom3A2ABU4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC39,43■■■■□ 3,9
Myom3A2ABU4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,42■■■■□ 3,9
Myom3A2ABU4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,35■■■■□ 3,89
Myom3A2ABU4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39,32■■■■□ 3,89
Myom3A2ABU4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
Myom3A2ABU4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,23■■■■□ 3,87
Myom3A2ABU4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
Myom3A2ABU4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC39,14■■■■□ 3,86
Myom3A2ABU4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC39,14■■■■□ 3,86
Myom3A2ABU4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,14■■■■□ 3,86
Myom3A2ABU4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC39,12■■■■□ 3,85
Myom3A2ABU4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39,11■■■■□ 3,85
Myom3A2ABU4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC39,09■■■■□ 3,85
Myom3A2ABU4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
Myom3A2ABU4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC39,04■■■■□ 3,84
Myom3A2ABU4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,03■■■■□ 3,84
Myom3A2ABU4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC39,01■■■■□ 3,84
Myom3A2ABU4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,99■■■■□ 3,83
Myom3A2ABU4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC38,97■■■■□ 3,83
Myom3A2ABU4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38,97■■■■□ 3,83
Myom3A2ABU4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,96■■■■□ 3,83
Myom3A2ABU4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38,93■■■■□ 3,82
Myom3A2ABU4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,93■■■■□ 3,82
Myom3A2ABU4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,92■■■■□ 3,82
Myom3A2ABU4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38,91■■■■□ 3,82
Myom3A2ABU4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC38,91■■■■□ 3,82
Myom3A2ABU4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38,91■■■■□ 3,82
Myom3A2ABU4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,88■■■■□ 3,81
Myom3A2ABU4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38,86■■■■□ 3,81
Myom3A2ABU4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38,85■■■■□ 3,81
Myom3A2ABU4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC38,83■■■■□ 3,81
Myom3A2ABU4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,8
Myom3A2ABU4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC38,8■■■■□ 3,8
Myom3A2ABU4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Myom3A2ABU4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38,79■■■■□ 3,8
Myom3A2ABU4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,76■■■■□ 3,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,7 ms