Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700018G05RikA0A1B0GSI2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700018G05RikA0A1B0GSI2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms