Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trbv15A0A0A6YYE3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trbv15A0A0A6YYE3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trbv15A0A0A6YYE3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trbv15A0A0A6YYE3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trbv15A0A0A6YYE3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trbv15A0A0A6YYE3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trbv15A0A0A6YYE3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trbv15A0A0A6YYE3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trbv15A0A0A6YYE3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trbv15A0A0A6YYE3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trbv15A0A0A6YYE3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trbv15A0A0A6YYE3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trbv15A0A0A6YYE3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trbv15A0A0A6YYE3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trbv15A0A0A6YYE3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trbv15A0A0A6YYE3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trbv15A0A0A6YYE3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trbv15A0A0A6YYE3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trbv15A0A0A6YYE3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trbv15A0A0A6YYE3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trbv15A0A0A6YYE3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trbv15A0A0A6YYE3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trbv15A0A0A6YYE3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trbv15A0A0A6YYE3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv15A0A0A6YYE3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv15A0A0A6YYE3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv15A0A0A6YYE3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trbv15A0A0A6YYE3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trbv15A0A0A6YYE3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trbv15A0A0A6YYE3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trbv15A0A0A6YYE3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trbv15A0A0A6YYE3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trbv15A0A0A6YYE3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbv15A0A0A6YYE3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trbv15A0A0A6YYE3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trbv15A0A0A6YYE3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trbv15A0A0A6YYE3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trbv15A0A0A6YYE3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trbv15A0A0A6YYE3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trbv15A0A0A6YYE3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trbv15A0A0A6YYE3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trbv15A0A0A6YYE3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trbv15A0A0A6YYE3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trbv15A0A0A6YYE3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trbv15A0A0A6YYE3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trbv15A0A0A6YYE3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbv15A0A0A6YYE3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trbv15A0A0A6YYE3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trbv15A0A0A6YYE3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trbv15A0A0A6YYE3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trbv15A0A0A6YYE3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trbv15A0A0A6YYE3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trbv15A0A0A6YYE3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trbv15A0A0A6YYE3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trbv15A0A0A6YYE3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trbv15A0A0A6YYE3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trbv15A0A0A6YYE3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trbv15A0A0A6YYE3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trbv15A0A0A6YYE3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trbv15A0A0A6YYE3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trbv15A0A0A6YYE3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trbv15A0A0A6YYE3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trbv15A0A0A6YYE3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trbv15A0A0A6YYE3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trbv15A0A0A6YYE3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trbv15A0A0A6YYE3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trbv15A0A0A6YYE3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv15A0A0A6YYE3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv15A0A0A6YYE3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv15A0A0A6YYE3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv15A0A0A6YYE3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trbv15A0A0A6YYE3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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