Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY38

Ighv1-42, Immunoglobulin heavy variable V1-42 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ighv1-42A0A0A6YY38 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ighv1-42A0A0A6YY38 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ighv1-42A0A0A6YY38 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ighv1-42A0A0A6YY38 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ighv1-42A0A0A6YY38 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ighv1-42A0A0A6YY38 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ighv1-42A0A0A6YY38 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ighv1-42A0A0A6YY38 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ighv1-42A0A0A6YY38 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ighv1-42A0A0A6YY38 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ighv1-42A0A0A6YY38 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ighv1-42A0A0A6YY38 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ighv1-42A0A0A6YY38 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ighv1-42A0A0A6YY38 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ighv1-42A0A0A6YY38 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ighv1-42A0A0A6YY38 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ighv1-42A0A0A6YY38 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ighv1-42A0A0A6YY38 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ighv1-42A0A0A6YY38 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ighv1-42A0A0A6YY38 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ighv1-42A0A0A6YY38 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ighv1-42A0A0A6YY38 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ighv1-42A0A0A6YY38 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ighv1-42A0A0A6YY38 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ighv1-42A0A0A6YY38 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ighv1-42A0A0A6YY38 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ighv1-42A0A0A6YY38 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ighv1-42A0A0A6YY38 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ighv1-42A0A0A6YY38 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ighv1-42A0A0A6YY38 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ighv1-42A0A0A6YY38 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ighv1-42A0A0A6YY38 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ighv1-42A0A0A6YY38 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ighv1-42A0A0A6YY38 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ighv1-42A0A0A6YY38 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ighv1-42A0A0A6YY38 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ighv1-42A0A0A6YY38 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ighv1-42A0A0A6YY38 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ighv1-42A0A0A6YY38 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ighv1-42A0A0A6YY38 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ighv1-42A0A0A6YY38 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ighv1-42A0A0A6YY38 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ighv1-42A0A0A6YY38 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ighv1-42A0A0A6YY38 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ighv1-42A0A0A6YY38 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ighv1-42A0A0A6YY38 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ighv1-42A0A0A6YY38 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ighv1-42A0A0A6YY38 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ighv1-42A0A0A6YY38 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ighv1-42A0A0A6YY38 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ighv1-42A0A0A6YY38 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms