Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ44

Srcap, Snf2-related CREBBP activator protein, mousemouse

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Length 3,271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrcapA0A087WQ44 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31,51■■■□□ 2,63
SrcapA0A087WQ44 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
SrcapA0A087WQ44 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
SrcapA0A087WQ44 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31,49■■■□□ 2,63
SrcapA0A087WQ44 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
SrcapA0A087WQ44 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
SrcapA0A087WQ44 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
SrcapA0A087WQ44 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
SrcapA0A087WQ44 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31,35■■■□□ 2,61
SrcapA0A087WQ44 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,29■■■□□ 2,6
SrcapA0A087WQ44 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,29■■■□□ 2,6
SrcapA0A087WQ44 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31,28■■■□□ 2,6
SrcapA0A087WQ44 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
SrcapA0A087WQ44 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
SrcapA0A087WQ44 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
SrcapA0A087WQ44 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31,22■■■□□ 2,59
SrcapA0A087WQ44 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
SrcapA0A087WQ44 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,18■■■□□ 2,58
SrcapA0A087WQ44 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,14■■■□□ 2,58
SrcapA0A087WQ44 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
SrcapA0A087WQ44 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
SrcapA0A087WQ44 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
SrcapA0A087WQ44 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
SrcapA0A087WQ44 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
SrcapA0A087WQ44 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
SrcapA0A087WQ44 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
SrcapA0A087WQ44 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
SrcapA0A087WQ44 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
SrcapA0A087WQ44 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30,97■■■□□ 2,55
SrcapA0A087WQ44 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
SrcapA0A087WQ44 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
SrcapA0A087WQ44 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
SrcapA0A087WQ44 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
SrcapA0A087WQ44 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
SrcapA0A087WQ44 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
SrcapA0A087WQ44 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,53
SrcapA0A087WQ44 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,87■■■□□ 2,53
SrcapA0A087WQ44 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
SrcapA0A087WQ44 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
SrcapA0A087WQ44 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
SrcapA0A087WQ44 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
SrcapA0A087WQ44 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
SrcapA0A087WQ44 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
SrcapA0A087WQ44 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
SrcapA0A087WQ44 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30,7■■■□□ 2,51
SrcapA0A087WQ44 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
SrcapA0A087WQ44 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30,69■■■□□ 2,5
SrcapA0A087WQ44 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
SrcapA0A087WQ44 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
SrcapA0A087WQ44 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
SrcapA0A087WQ44 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
SrcapA0A087WQ44 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
SrcapA0A087WQ44 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30,67■■■□□ 2,5
SrcapA0A087WQ44 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,64■■■□□ 2,5
SrcapA0A087WQ44 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
SrcapA0A087WQ44 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
SrcapA0A087WQ44 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
SrcapA0A087WQ44 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
SrcapA0A087WQ44 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
SrcapA0A087WQ44 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,54■■■□□ 2,48
SrcapA0A087WQ44 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
SrcapA0A087WQ44 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
SrcapA0A087WQ44 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30,49■■■□□ 2,47
SrcapA0A087WQ44 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
SrcapA0A087WQ44 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,47■■■□□ 2,47
SrcapA0A087WQ44 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
SrcapA0A087WQ44 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,36■■■□□ 2,45
SrcapA0A087WQ44 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30,34■■■□□ 2,45
SrcapA0A087WQ44 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30,32■■■□□ 2,44
SrcapA0A087WQ44 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
SrcapA0A087WQ44 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
SrcapA0A087WQ44 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
SrcapA0A087WQ44 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,22■■■□□ 2,43
SrcapA0A087WQ44 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30,2■■■□□ 2,42
SrcapA0A087WQ44 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30,19■■■□□ 2,42
SrcapA0A087WQ44 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,15■■■□□ 2,42
SrcapA0A087WQ44 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,41
SrcapA0A087WQ44 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
SrcapA0A087WQ44 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30,12■■■□□ 2,41
SrcapA0A087WQ44 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
SrcapA0A087WQ44 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
SrcapA0A087WQ44 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30,08■■■□□ 2,41
SrcapA0A087WQ44 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,07■■■□□ 2,4
SrcapA0A087WQ44 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
SrcapA0A087WQ44 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,06■■■□□ 2,4
SrcapA0A087WQ44 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
SrcapA0A087WQ44 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
SrcapA0A087WQ44 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
SrcapA0A087WQ44 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,04■■■□□ 2,4
SrcapA0A087WQ44 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
SrcapA0A087WQ44 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
SrcapA0A087WQ44 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
SrcapA0A087WQ44 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
SrcapA0A087WQ44 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
SrcapA0A087WQ44 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
SrcapA0A087WQ44 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
SrcapA0A087WQ44 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,92■■■□□ 2,38
SrcapA0A087WQ44 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
SrcapA0A087WQ44 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
SrcapA0A087WQ44 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms