Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5I0

Ighv1-13, Immunoglobulin heavy variable V1-13, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-13A0A075B5I0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ighv1-13A0A075B5I0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighv1-13A0A075B5I0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ighv1-13A0A075B5I0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ighv1-13A0A075B5I0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ighv1-13A0A075B5I0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighv1-13A0A075B5I0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ighv1-13A0A075B5I0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ighv1-13A0A075B5I0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ighv1-13A0A075B5I0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ighv1-13A0A075B5I0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ighv1-13A0A075B5I0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ighv1-13A0A075B5I0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighv1-13A0A075B5I0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighv1-13A0A075B5I0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ighv1-13A0A075B5I0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ighv1-13A0A075B5I0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ighv1-13A0A075B5I0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ighv1-13A0A075B5I0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ighv1-13A0A075B5I0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighv1-13A0A075B5I0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighv1-13A0A075B5I0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighv1-13A0A075B5I0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ighv1-13A0A075B5I0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ighv1-13A0A075B5I0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ighv1-13A0A075B5I0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighv1-13A0A075B5I0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ighv1-13A0A075B5I0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ighv1-13A0A075B5I0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ighv1-13A0A075B5I0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighv1-13A0A075B5I0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighv1-13A0A075B5I0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighv1-13A0A075B5I0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ighv1-13A0A075B5I0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighv1-13A0A075B5I0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighv1-13A0A075B5I0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv1-13A0A075B5I0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv1-13A0A075B5I0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv1-13A0A075B5I0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighv1-13A0A075B5I0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighv1-13A0A075B5I0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighv1-13A0A075B5I0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighv1-13A0A075B5I0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ighv1-13A0A075B5I0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ighv1-13A0A075B5I0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ighv1-13A0A075B5I0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighv1-13A0A075B5I0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighv1-13A0A075B5I0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ighv1-13A0A075B5I0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ighv1-13A0A075B5I0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ighv1-13A0A075B5I0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ighv1-13A0A075B5I0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ighv1-13A0A075B5I0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ighv1-13A0A075B5I0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighv1-13A0A075B5I0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighv1-13A0A075B5I0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighv1-13A0A075B5I0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv1-13A0A075B5I0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv1-13A0A075B5I0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv1-13A0A075B5I0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighv1-13A0A075B5I0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ighv1-13A0A075B5I0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ighv1-13A0A075B5I0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighv1-13A0A075B5I0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighv1-13A0A075B5I0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighv1-13A0A075B5I0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ighv1-13A0A075B5I0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ighv1-13A0A075B5I0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ighv1-13A0A075B5I0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighv1-13A0A075B5I0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighv1-13A0A075B5I0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighv1-13A0A075B5I0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighv1-13A0A075B5I0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighv1-13A0A075B5I0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighv1-13A0A075B5I0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighv1-13A0A075B5I0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighv1-13A0A075B5I0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ighv1-13A0A075B5I0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ighv1-13A0A075B5I0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ighv1-13A0A075B5I0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ighv1-13A0A075B5I0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ighv1-13A0A075B5I0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ighv1-13A0A075B5I0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ighv1-13A0A075B5I0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighv1-13A0A075B5I0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ighv1-13A0A075B5I0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighv1-13A0A075B5I0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighv1-13A0A075B5I0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighv1-13A0A075B5I0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighv1-13A0A075B5I0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighv1-13A0A075B5I0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ighv1-13A0A075B5I0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ighv1-13A0A075B5I0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 365.3 ms