Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms