Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms