Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms