Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms