Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms