Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms