Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms