Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms