Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPHKAPQ2M3C7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHKAPQ2M3C7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHKAPQ2M3C7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHKAPQ2M3C7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHKAPQ2M3C7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHKAPQ2M3C7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHKAPQ2M3C7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHKAPQ2M3C7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHKAPQ2M3C7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHKAPQ2M3C7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHKAPQ2M3C7 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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