Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms