Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITSN1Q15811 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ITSN1Q15811 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ITSN1Q15811 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ITSN1Q15811 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITSN1Q15811 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITSN1Q15811 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITSN1Q15811 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITSN1Q15811 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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