Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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SYCP1Q15431 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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SYCP1Q15431 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
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SYCP1Q15431 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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SYCP1Q15431 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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