Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms