Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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