Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms