Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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