Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms