Protein–RNA interactions for Protein: Q01581

HMGCS1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1Q01581 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCS1Q01581 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms