Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms