Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms