Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF6P49848 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms