Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms