Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms