Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XPAP23025 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XPAP23025 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XPAP23025 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XPAP23025 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XPAP23025 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XPAP23025 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
XPAP23025 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
XPAP23025 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
XPAP23025 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XPAP23025 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XPAP23025 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms