Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms