Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms