Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms