Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHIPQ8WWQ0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms