Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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USP53Q70EK8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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USP53Q70EK8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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